MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022784	CGA	2	6	155294	155299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_022784	AGC	2	6	155465	155470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_022784	GCA	2	6	155556	155561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_022784	GCT	3	9	155606	155614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_022784	CAAT	2	8	155627	155634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_022784	ATG	2	6	155724	155729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022784	TGG	2	6	155735	155740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022784	CAT	2	6	155741	155746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_022784	GCA	2	6	155778	155783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_022784	ATCA	2	8	155784	155791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_022784	GAA	2	6	155799	155804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022784	AGTC	2	8	155887	155894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_022784	AAG	2	6	155956	155961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022784	AGC	2	6	155989	155994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_022784	GCA	2	6	156039	156044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_022784	TGC	2	6	156050	156055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_022784	TCA	2	6	156133	156138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_022784	CCT	2	6	156222	156227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_022784	AAC	2	6	156233	156238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_022784	ATGC	2	8	156258	156265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_022784	GCA	2	6	156444	156449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_022784	GAC	2	6	156468	156473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_022784	AAG	2	6	156613	156618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022784	CAA	2	6	156624	156629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_022784	GCAG	2	8	156670	156677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_022784	CTG	2	6	156693	156698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_022784	CAG	2	6	156740	156745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_022784	CAG	2	6	156770	156775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_022784	CAA	2	6	156776	156781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_022784	CAG	2	6	156782	156787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_022784	TCT	2	6	156788	156793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_022784	CTACC	2	10	156813	156822	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1033	NC_022784	G	6	6	156924	156929	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_022784	CTT	2	6	156941	156946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_022784	AAG	2	6	156978	156983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_022784	GCC	2	6	156997	157002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_022784	TGA	2	6	157041	157046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_022784	TTCG	2	8	157087	157094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_022784	GTT	2	6	157106	157111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022784	TAA	2	6	157130	157135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022784	TC	3	6	157172	157177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_022784	CTT	2	6	157184	157189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_022784	CGG	2	6	157212	157217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_022784	ATT	2	6	157273	157278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_022784	GTC	2	6	157294	157299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_022784	A	6	6	157368	157373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_022784	AAG	2	6	157393	157398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_022784	ACA	2	6	157408	157413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_022784	TTC	2	6	157417	157422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_022784	AAG	2	6	157490	157495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_022784	N	48	48	157548	157595	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_022784	ATT	2	6	157600	157605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_022784	GTC	2	6	157621	157626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_022784	A	6	6	157698	157703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022784	AAG	2	6	157723	157728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022784	ACA	2	6	157738	157743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_022784	TTC	2	6	157747	157752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_022784	AAG	2	6	157820	157825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022784	CT	4	8	157914	157921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_022784	AGC	2	6	157981	157986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_022784	AGG	2	6	158007	158012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022784	GGA	2	6	158089	158094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022784	AAT	2	6	158119	158124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022784	GCA	2	6	158143	158148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_022784	GA	3	6	158157	158162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_022784	TG	3	6	158207	158212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022784	AACTGC	2	12	158298	158309	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_022784	GAT	2	6	158327	158332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_022784	GGA	2	6	158484	158489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_022784	TTG	2	6	158493	158498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_022784	GC	3	6	158541	158546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_022784	G	6	6	158594	158599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_022784	AAAG	2	8	158616	158623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022784	TGG	2	6	158625	158630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_022784	CG	3	6	158670	158675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_022784	TAA	2	6	158692	158697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_022784	AAC	2	6	158718	158723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_022784	ATG	2	6	158808	158813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_022784	GA	3	6	158838	158843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022784	GCG	2	6	158882	158887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_022784	GAA	2	6	158901	158906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_022784	GCG	2	6	158909	158914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_022784	GC	3	6	159023	159028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_022784	CGAAA	2	10	159068	159077	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_022784	CGCCTG	2	12	159088	159099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_022784	CTT	2	6	159101	159106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_022784	GCA	2	6	159128	159133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_022784	TGT	2	6	159134	159139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_022784	AGT	2	6	159146	159151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_022784	AGC	2	6	159178	159183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_022784	TGA	2	6	159239	159244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_022784	GGCG	2	8	159263	159270	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_022784	GCT	2	6	159318	159323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_022784	CTG	2	6	159358	159363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_022784	AAC	2	6	159377	159382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022784	ATA	2	6	159403	159408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_022784	GCA	2	6	159473	159478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_022784	CAG	3	9	159531	159539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_022784	AGC	2	6	159628	159633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_022784	GCACG	2	10	159634	159643	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1101	NC_022784	GCA	2	6	159644	159649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_022784	ACA	2	6	159659	159664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_022784	GC	3	6	159673	159678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_022784	AAC	2	6	159688	159693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_022784	CTC	2	6	159706	159711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_022784	GCC	2	6	159770	159775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_022784	CTG	2	6	159779	159784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_022784	TAT	2	6	160342	160347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022784	CGAG	2	8	160455	160462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_022784	GAT	2	6	160476	160481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022784	CTA	2	6	161291	161296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_022784	CTG	2	6	161306	161311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_022784	GCT	2	6	161317	161322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_022784	AAC	2	6	161933	161938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_022784	ACTTA	2	10	161948	161957	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_022784	CAT	2	6	161983	161988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_022784	GGA	2	6	163848	163853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022784	TGC	2	6	163929	163934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_022784	GAT	2	6	163986	163991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022784	TG	3	6	164048	164053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022784	GCT	2	6	164161	164166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_022784	GCAA	2	8	164168	164175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_022784	TGC	2	6	166885	166890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_022784	CG	3	6	166913	166918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_022784	CCA	2	6	166919	166924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_022784	TTC	2	6	167025	167030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_022784	TG	3	6	167033	167038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_022784	GCC	2	6	167053	167058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_022784	CGTGT	2	10	167130	167139	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1130	NC_022784	TG	3	6	168298	168303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022784	TTGCT	2	10	168327	168336	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1132	NC_022784	TGG	2	6	168372	168377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_022784	TGG	2	6	170292	170297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1404	NC_022784	AGC	2	6	242348	242353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_022784	TGAT	2	8	242515	242522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_022784	GAT	2	6	242573	242578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1438	NC_022784	GTC	2	6	248974	248979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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